怀孕50天最好不要药流，这是由于药流的适应症，是怀孕49天之内的孕妇才可以吃的药。如果到50天，胚胎发育比较大，药流药物吃下去以后，可能会导致药流的失败，也就是有可能胚胎不会流出来，到时候要做清宫手术。有的时候即使胚胎流出来，但是胎盘、胎膜残留在子宫腔比较多。手术半个月到医院去复查，B超里面可能还会有残留的东西。
所以药物流产一般是指小于49天之内的胚胎，而且临床证据表明，胚胎越小，成功率越高，所以如果是怀孕50天，尽量做人工流产手术。