E抗体阴性说明有可能E抗原还是阳性，有可能存在大三阳的情况，病人可能还有病毒复制，或者E抗原也已经转阴，表面抗原阳性和核心抗体阳性，也就是所谓的小二阳。
对于大三阳病人如果DNA阳性，将来出现转氨酶的升高，就需要抗病毒治疗。
如果是表面抗原阳性和核心抗体阳性，两个所谓的小二阳，是出于大三阳的病人抗病毒治疗，E抗原已经阴转，但E抗体还没有出现，出现两个阳性，即表面抗原阳性和核心抗体阳性，而E抗原和E抗体都是阴性。
对于这类病人经过抗病毒治疗，追求的是大三阳转成小三阳，最后表面抗原阴转，大三阳已经阴转E抗原，但是E抗体还没有出来，还没有变成小三阳，距离表面抗原阴转相对来说更远一些。
所以E抗体单纯阴性的顶多说明抗病毒治疗还没有达到最佳的效果，还没有达到大三阳转成小三阳，距离表面抗原阴转还有一段距离。