能够透过血脑屏障的抗生素有哌拉西林、阿莫西林、头孢曲松、甲硝唑以及异烟肼、吡嗪酰胺、利福平，抗病毒的药有阿昔洛韦、利巴韦林。如果出现炎症，会使血脑屏障降低，也就是有些抗生素也会通过血脑屏障，比较见于青霉素、头孢呋辛钠、头孢噻肟、头孢他啶、头孢哌酮、头孢吡肟以及美罗培南、阿米卡星、克林霉素、万古霉素等。抗生素通过血脑屏障，可以对脊柱还有脑部的炎症更好的控制。