喉咙有痰不舒服，是因为发生了咽喉炎的情况，也就是平时所说的上呼吸道感染，一般是由感冒病毒造成的，细菌性感染往往发生在病毒性感染之后。支原体或者衣原体也有可能会导致上呼吸道感染，引起咽喉炎的情况。
一旦咽喉部有炎症的出现，局部就会有充血和水肿，伴随炎症，也会有红、肿、热、痛的现象出现，所以会感觉喉咙不舒服。炎性的部位也会分泌炎性分泌物，体内的炎症细胞也会聚集在咽喉部吞噬外来的病毒或者细菌。随着细胞发生裂解和坏死，尸体就会堆积在咽喉部。
咽喉部也会有黏膜的脱落，导致痰液的形成，会感觉喉咙有痰不舒服。需要服用消炎类的药物，比如蒲地蓝消炎口服液，还有化痰类的药物，比如肺力咳合剂进行治疗。