导致新生儿脸上出现湿疹的原因十分复杂，多认为与变应原所引起的变态反应有关。新生儿面部湿疹与多种内外因素有关，内因主要与婴儿皮肤特性和过敏体质有关，有先天的体质因素，有些新生儿属于过敏体质，对接触的毛制品、灰尘、花粉或食物，比如牛奶等过敏。
此外，也有后天营养失调、营养过剩、消化不良、衣着不当、紫外线、寒冷、炎热等物理因素，以及与搔抓等机械性摩擦、唾液和奶液等刺激、过度洗浴，或使用较强的洗涤剂等有关，以上都是可能引起新生儿面部湿疹的外在因素。