尿道下裂术后肯定会有后遗症，尿道下裂术后可能会有出血和血肿的可能性，尿道外口可能有狭窄的发生，狭窄可能与龟头成形时太紧，尿道外口直径太小有关。可能会出现尿道皮肤瘘，尿道皮肤瘘的发生，主要与血供不好、远端梗阻以及使用不可吸收线或者使用的线组织反应过大有关，可能会出现有感染。尿道下裂术后还可能出现尿道憩室，尿道憩室形成主要就是成形尿道过于宽大。可能出现阴茎下弯、矫正不良。尿道下裂手术时残留相关组织、新尿道太短或者手术后瘢痕，会导致阴茎形态下弯，也会出现尿道狭窄。这些都是最常出现的后遗症。