在经期可以吃甲硝唑片，在某些情况下比如盆腔炎性疾病、泌尿系感染，需要应用甲硝唑来进行治疗，在月经来潮后仍然可以继续应用。
如果有阴道的局部炎症，需要给予甲硝唑类药物的阴道塞用，此时在月经来潮后不适合阴道塞用，但是可以通过口服途径应用。
甲硝唑的治疗周期根据疾病的不同会有所区别，如果是盆腔炎性疾病引起的盆腔感染，总体应用的时间是10-14天，即使在这中间有月经来潮，也不需要停用。