口腔扁平苔藓能够自愈，但是，需要根据病因来决定，如果是由于心理因素所引起，通常情况下经过身心的调节，调整好心理状态，并且调节全身的状况，例如睡眠、消化功能或者月经状况，这时口腔扁平苔藓就能够自愈。口腔扁平苔藓已经出现较大的损害时需要使用药物治疗，例如维A酸类药物对于角化程度较高的患者比较适用。可以选择使用肾上腺皮质激素，还可以使用抗真菌药物，例如伴发白色念珠菌感染，可以使用制霉菌素进行局部涂抹。因为很多口腔扁平苔藓是由于身体抵抗力低下所引起的，所以建议提高机体抵抗力。另外，需要使用免疫抑制剂，例如雷公藤、昆明山海棠或者羟氯喹，都可以治疗口腔扁平苔藓。