胃部CT不能够代替胃镜检查，两者在诊断胃部疾病时各有优缺点，可以互相补充，而不能相互替代。胃属于空腔脏器，CT平扫很难看清楚，即使行增强CT扫描，也是从胃内是否有肿物，肿物与胃壁的关系，以及胃周围有没有淋巴结肿大，这三个方面来进行判断。
CT平扫并不能像胃镜一样，可以直观地观察胃腔内黏膜的情况，肿物、溃疡的形态，以及取病理活检内镜下治疗等等。当发现有胃部病变时，最好两者结合检查，取长补短，可以更全面的评估病情，制定更精准、优化的治疗方案。