阿莫西林与藿香正气水的区别非常大，是两种不同的药物，治疗方向也不同。阿莫西林是抗生素，主要任务是杀灭细菌，保卫人体健康。藿香正气水作为一种中成药，可以解表化湿，理气和中，通过调节人体的内环境达到治病的目的，对于外感风寒湿邪所导致的感冒、腹泻等，都可以应用藿香正气水进行调整。阿莫西林对于细菌引起的感冒具有非常好的效果，可以直接将细菌杀灭，可以减轻细菌对人体的破坏。藿香正气水可以治疗感冒，但是，治疗的方式不是杀灭细菌，而是调动人体的免疫细胞共同参与到消灭细菌的战争中，这种方式就是中医特有的方式，和阿莫西林截然不同。