鞍区脊索瘤手术治疗方法，主要是以手术全切为主要目的，手术暴露和切除是手术需要面临的主要问题，入路的选择需要针对肿瘤的部位如何到达为主要面临的问题。对于基本位于中线而不偏向任何一侧的肿瘤全切除困难，并且容易使一侧脑神经受损，对于偏于一侧的肿瘤全切除可能性增加。手术原则上应该以首先切除压迫脑干的肿瘤为主，可以考虑进一步切除肿瘤，使放射治疗的负荷减少。对脑干压迫的病人以硬脑膜下入路为首选，手术之后需要联合放射治疗，这样可以提高治疗效果。