患者做巧克力囊肿(即巧囊)手术一般住院需要5-7天左右，住院天数因人而异，大致情况如下：
1、做腹腔镜微创手术：这种手术本身的创伤比较小，所以术后身体恢复比较快，大约需要住院3-5天即可出院。
2、做开腹手术：这种手术对女性身体创伤比较大，住院时间会相对延长，需要七天左右。
3、其他情况：如果做巧克力囊肿手术以后，术后病理结果为恶性，还需要进行下一步的放化疗，所以住院时间也会相对延长。
巧克力囊肿在妇科是一种非常常见的疾病，如果囊肿比较小，小于4cm，患者可以应用药物进行治疗。如果巧克力囊肿已经大于4cm，并且随时出现巧克力囊肿急腹痛、扭转的情况，这个时候需要及时做手术治疗。手术治疗方式可以分为腹腔镜微创或者开腹手术，具体选择哪种手术方式，根据患者病情而决定。