男性外生殖器流脓可能的原因：一、淋病，是一种性病，通过不洁的性接触而导致淋球菌感染，典型的表现就是尿道口流出黄色的脓液，量比较多，同时伴有尿道内刺痛，伴有尿频、尿急、排尿疼痛，一般都有明确的不洁性接触史，需要进行淋球菌培养和涂片检查，来进一步的确诊。二、非特异性尿道炎，如大肠埃希菌感染或者金葡菌感染，这时可以出现尿道流脓，没有不洁的性接触史，可发生于机体免疫力较低或者局部污染的情况下，一般都会伴有尿频、尿急、发热或者尿不尽感等。三、非淋球菌性尿道炎，也是一种性传播的疾病，它是支原体、衣原体感染所致，可以出现尿道口流出稀薄的脓液，有时脓液黏稠干燥后可以糊住尿道口，同时可伴有尿道内的瘙痒和刺痛感，需要进行支原体、衣原体检查来确诊。