慢性小脑电刺激可能会出现以下的并发症：
1、颅内局部的血肿块，在刺激部位可能出现小的颅内局部出血。
2、慢性小脑电刺激，可能会引起脑脊液漏、接收器周边积液的情况。
3、可以引起伤口不必要的感染。
4、少部分接受慢性小脑电刺激治疗的患者，可能有头痛的症状出现。
所以医生应在进行慢性小脑电刺激的操作中严格执行技术规范，术后应当预防感染，并且对病人进行定期复查，避免各种并发症的产生。慢性小脑电刺激能明显激发小脑的功能，而抑制大脑延髓、脊髓的神经电活动，达到临床的治疗效果。