全身骨显像的检查没有什么太大的副作用。这种检查是一种有放射性的检查，唯一的缺点就是有一定的辐射作用。但是对于帮助患者诊断疾病，这种辐射的危害就很小。
全身骨扫描的检查需要注射一种药物，是核素。核素含有放射性，一般的患者在检查完两天内尽量和家属隔离。两天之后患者自身的辐射剂量就几乎为零，对周边的人不会产生什么影响。患者检查完后建议多喝水，这样可以加快新陈代谢，有利于药物从体内快速的排出。