全喉切除以后的后遗症主要是全喉切除以后失去了喉功能，喉部功能主要是发声功能、呼吸功能或者辅助吞咽功能。全喉切除以后形成颈前的气管造口不能通过正常的口咽部进行呼吸，所以没有了喉部的呼吸功能，也没有发声功能，但是不影响吞咽的功能。现在有进行培训的食管发音，也可以做全喉切除以后做食道的发音管进行发声，一般不影响病人的交流。也有些做全喉切除的病人会引起患者自卑的心理障碍，导致社交困难或者社交的自卑感。