吴茱萸具有散寒止痛，疏肝下气，助阳止泻，降血压，保护血管，镇痛等作用。对于人体出现的肝寒气滞以及身体出现的厥阴头痛、疝气、脚气肿痛以及肝郁化火、肝胃不和、肋痛口苦、吞酸、脾虚泄泻等症状，都有良好的调理和治疗作用；对于身体出现的血压过高，也具有明显的降压作用。
还可以控制血小板的凝聚，抑制血小板栓塞以及纤维蛋白原形成的栓塞症状，可以保护血管，防止动脉硬化。对于身体具有中枢神经系统镇痛的作用，对身体出现的霍乱弧菌以及铁锈色小芽孢癣菌以及皮肤真菌感染，也有明显的抑制和抗真菌作用。