肛门周围长了很多小疙瘩，首先应当分析一下肛周小疙瘩的性质，应当观察它的颜色、柔软度、活动度、有没有出血、有没有创面。如果是肛周湿疣，一般具有传染性，可以局部切除，做一个快速病理。确定是肛门湿疣，可以用内、外治疗，主要是口服中药进行清热除湿，然后再加上藏红花等中药泡洗。
如果肛周长的小疙瘩质地比较硬、发白，可以手术切除。手术切除的创面比较大、比较痛苦，或者可以用冷冻疗法，可以使疣状物坏死、脱落。还有激光治疗，采用烧灼法治疗湿疣；还有电灼治疗；还有一种常见的微波治疗。
还有比较先进的一种治疗方式，β射线治疗，这种疗效比较好，无痛苦，但是费用比较高。所以，应当先明确肛周小疙瘩的病理性质。如果是恶性的，不除外是肛管癌，这种应当按普外科的直肠癌方法根治。所以，先确定它的性质，然后采取不同的治疗方法。