药物没有最好，只有最合适。上呼吸道感染最常用的药物有阿莫西林、头孢克肟、左氧氟沙星、罗红霉素等。小儿常用头孢克肟颗粒、阿奇霉素糖浆。亦可以口服清热解毒的中成药，一般均具有消炎的作用，如银黄口服液，具有清热疏风、利咽解毒的功效，适用于外感风热、肺胃实热所致的咽喉疼痛、口渴、发热等症状。
银翘解毒片具有疏风解表、清热解毒的功效，适用于风热感冒引起的发热、头痛、咳嗽、口干、咽喉疼痛等症状。也可以给予牛黄解毒片，具有清热解毒的作用。蒲地蓝消炎口服液具有清热解毒、抗炎消肿的作用。
如果是小儿，可以口服小儿速热清口服液，具有清热解毒、泻火利咽的功效，适用于小儿外感引起的发热、头痛、咽喉疼痛、鼻塞、流鼻涕、打喷嚏、大便干燥等症状。