肛瘘通过手术多能治愈，手术治疗的原则是将瘘管全部切开，必要时将瘘管周围的瘢痕组织同时切除，根据瘘管的深浅、曲直，选用不同的手术治疗方法。第一、切开引流的术式，当肛瘘处于作期合并感染，脓液积聚时，而病人身体不耐受手术，这是选择切开引流，待病人身体好转时再行根治性手术治疗。第二、挂线术，当病人的肛瘘诊断为高位肛瘘，或者是多瘘管的复杂性肛瘘，是为了保护括约肌的功能，避免病人术后肛门失禁，多选择瘘道切开内口挂线术。第三、肛瘘切开术，这是肛瘘最经典和最主流的术式，90%以上的低位肛瘘，采用肛漏切开术。第四、瘘管剔除术，对于肛瘘的瘘管完全粘连，而探针无法探入时，这是选择将瘘管完整剔除的手术方式。