脑血栓的治疗在以往的时候主要依靠神经内科应用静脉溶栓药物为主内科保守治疗。这些年随着神经介入医学的发展，逐渐出现神经介入手术的治疗。
神经介入手术治疗就是在股动脉处进行穿刺，置入股动脉鞘，放入导管进行脑血管的造影，发现阻塞的血管，进入微导管通过血栓处释放支架，用支架进行取栓治疗，取栓治疗的同时还可以进行血栓的抽吸治疗。
如果上述两种办法都没有明显的效果也可以把微导管放在阻塞处进行动脉溶栓治疗，这是目前脑血栓的手术主要的治疗方案。