松果体属于间脑的一种结构，它与上丘脑的关系比较密切，属于一种内分泌器官。解剖位置位于胼胝体压部以及中脑上丘之间，而且在中岛两个上丘之间的凹陷处，表现为1个卵圆形或者是扁锥形的淡红色小体。重量大约为0.2g，长度约5-19mm，宽度约5-9mm，高度大约1.5-4mm。腺体底部朝向前方，借助1个比较短的松果体柄，以及缰联合和后联合附着于第三脑室室顶后部，被胼胝体的压部所遮盖。松果体与大脑大静脉前端的距离大约为6mm，与小脑幕切迹后缘的距离大约为9mm。