药物流产后第三天肚子疼，说明药物流产胎囊排出后还有肚子疼，要考虑是不是有阴道流血，是不是蜕模没有排干净。
这种肚子疼是不用紧张的，特别是阵发性腹痛，就是一阵阵肚子疼，一会疼，一会好了，一会再疼，往往是宫缩引起的。这种疼不可怕，说明在排泄宫腔内多余的残留物，会有点肚子疼。
如果是肚子疼伴有发烧就不好了，很可能是有继发感染，应该及时到医院就诊，要查血常规看看有没有白细胞的增多、中性粒细胞增多，有没有炎症的发生。
如果有炎症一定要抗炎治疗，免得出现慢性的转归，到时候是很麻烦的事。