阿莫西林和阿奇霉素都是抗菌药物，都可以用来治疗细菌等病原体感染，但是属于不同类别。阿莫西林属于青霉素类药物，青霉素过敏的人就没有办法用阿莫西林。
阿奇霉素不属于青霉素类，即便是青霉素过敏也可以应用阿奇霉素。另外，两者的抗菌谱也不太一样，两者都可以针对革兰阳性细菌、革兰阴性细菌起到有效的作用。
但是阿奇霉素与阿莫西林相比，还可以治疗支原体、衣原体、军团菌等不典型病原体的感染，所以抗菌谱更广。