抗生素长期应用也有一些危害，第一、抗生素的长期使用，可以使人体产生过敏反应，这个时候是绝对不能使用抗生素的。第二、抗生素一般也可以破坏人体正常的菌群，导致不敏感微生物的过度生长，比如霉菌和耐药菌等情况，到时还有可能会发生多重感染的情况。第三、抗生素长期使用可以加快细菌的进化，出现耐药菌株，比如超级细菌就是一种耐药菌。第四、有些抗生素长期使用还有一些特有的不良反应，比如氨基糖苷类的抗生素，包括庆大霉素、链霉素、卡那霉素、万古霉素等，还有可能导致药物性的耳聋和肾功能的损害。