患者做输卵管疏通术，根据输卵管堵塞的程度不同，有的人全程会没有任何不适感觉，而有的人会感觉比较痛甚至剧痛。轻微堵塞的患者，医生在输卵管中注入生理盐水时，管腔压力低于8KPa，这样的患者基本没有任何疼痛感。
若输卵管堵塞严重，注入生理盐水时会有一定的阻力，堵塞越严重，阻力越大，此时部分患者可能会有的疼痛感，但是手术中产生的疼痛感，通常都在人们的忍受范围之内。
正常情况下，手术中通液时的疼痛感在术后半个小时之后基本逐渐缓解。有些人如果体质比较敏感，可以在术前要求医生打麻药，做无痛疏通术。