系膜增生性肾炎患者的症状也是多样的，一般患者起病比较隐匿，常表现为无症状性的血尿，伴或不伴有蛋白尿，部分患者可能在体检的时候才被发现。有些患者在起病前有上呼吸道或者消化道的感染，在感染后出现肉眼血尿，可以持续数天，肉眼血尿常为全程无痛性，可以伴有蛋白尿。
另外，部分患者可以伴有高血压，极少数患者可以发生恶性高血压。还有部分患者表现为肾病综合征，还有不同程度的肾功能损害，不同临床症状表现的患者预后是不一样的。