新生儿的先天性心脏病的症状，与新生儿先天性心脏病的类型、心内的分流等情况有关系。比如孩子是左向右分流先天性心脏病，如房间隔缺损、室间隔缺损等，早期如果缺损不是很大，可能没有明显的症状。
如果缺损大，可能会引起呼吸费力、多汗、喂养困难，甚至喂养呛咳、生长发育缓慢，还容易引起感冒肺炎等表现。还有一种是右向左分流的先天性心脏病，比如法洛四联症、肺动脉瓣闭锁、肺动脉瓣狭窄等。
孩子会有紫绀的表现，就是手指头、脚趾头、口唇等表现紫绀，如果孩子大一些会有喜欢蹲着的现象。还有一类是没有心内分流的心脏病，比如单纯的主动脉弓缩窄等。
这类先天性心脏病如果缩窄不严重可能没有明显的表现，所以新生儿先天性心脏病与类型、分流等有关，对应的症状也不同。