对于男性性功能的检查，首先是了解病史，包括现病史、既往史，以及生活方式是否具有吸烟、酗酒等不良的生活习惯，还有社交、婚姻和性生活史。在体格检查方面，主要是针对全身各个系统进行相应的检查，尤其是泌尿生殖系统。实验室检查包括常规检查，比如血生化的检查、血脂代谢等。而激素水平的测定主要是针对内分泌性的相关病原进行测定，包括睾酮、泌乳素、甲状腺素、儿茶酚胺及其代谢产物。
特殊性的检查，主要是利用一些侵袭性或者非侵袭性的检查手段，包括夜间阴茎的胀大试验、阴茎的肱动脉血压指数、阴茎海绵体注射血管活性药物的试验、彩色双功能超声的检查。其它检查包括血管的造影、阴茎海绵体的测压、阴茎海绵体的造影、勃起功能障碍的神经检测，通过这一系列的检查，来了解血管和海绵体本身的情况，必要的时候要进行海绵体的活检来明确诊断。