男士做结扎手术以后，大约50%的人会经历阴囊肿胀、瘀斑和疼痛，但症状大多数轻微，1-2周内自然可以缓解。其他的影响主要就是近期并发症和长期的安全性问题，近期并发症主要包括出血与血肿、感染、痛性结节、附睾淤积症以及性功能障碍，总体发生率在2%左右，发生率与医生的经验有关。理论上讲结扎术并不影响性功能，但个别工作中，确实有一部分人发现了性功能障碍，究其原因主要是心理因素和继发于术后其他的并发症所导致。
至于长期安全性，主要是睾丸会发生一些纤维变以及玻璃样变，附睾有可能产生精子肉芽肿，输精管的残端也会出现精子肉芽肿。一部分人输精管结扎后，血清中可以检测出抗精子抗体，另外对心理或多或少有些人还是有影响。因为各种原因，如果需要恢复生育，还要面对复通以及复孕的成功率问题。