接种第一针乙型肝炎疫苗之后，只有30%的人可以产生乙型肝炎表面抗体，而且抗体效果很不稳定。接种第二针后，有90%的人可以产生抗体。接种第三针后，抗体的阳性率可以达到96%以上，而且抗体效果持续维持在较高水平。
乙型肝炎疫苗接种是在上臂三角肌肌肉注射，免疫程序均按0、1、6各注射一针，每针10μg。其他高危人群，如肾透析，以及其它职业性与乙型肝炎密切接触者，每针注射30μg。注射乙型肝炎疫苗可以刺激免疫系统产生保护性抗体，抗体存在于人的体液当中，乙型肝炎病毒一旦出现，抗体会立即作用来将其清除，以阻止感染。