恩替卡韦和阿德福韦酯同属于治疗慢性乙型肝炎抗病毒药物，均需要在有经验的医生指导下进行抗病毒治疗。临床疗效各有特点，合理使用都可以发挥很好的作用，不能笼统的说哪个好。
恩替卡韦是治疗慢性乙型肝炎的一线用药，它的作用机制是抑制乙肝病毒DNA多聚酶，能够通过磷酸化成为具有活性的三磷酸盐。三磷酸盐通过与乙肝病毒多聚酶的天然底物三磷酸脱氧鸟嘌呤核苷竞争，抑制乙肝病毒多聚酶的启动、前基因组逆转录酶负链的形成和乙肝病毒正链的合成，作用强大。阿德福韦酯属于二线用药，适用于长期用药已经发生拉米夫定耐药的患者，合理使用是关键。