肛周脓肿是肛周感染性疾病，有时肛周脓肿仅仅存在于表浅的皮肤和软组织，出现囊肿之后应及时进行抗生素应用和局部的切开引流，这样可以促进感染伤口的愈合，减少肛门脓肿发生肠瘘的可能。有时肛门脓肿和肛窦炎密切相关，由于肛道特殊的解剖结构和解剖部位，容易造成局部的损伤和感染，一旦处理不当会产生肛瘘的可能。
肛瘘导致的肛门脓肿，常常在肛门附近出现反复迁延不愈的炎症和脓肿。切开引流之后，脓肿消退，但是在创口可以留存小的外口。在这种情况下应及时到医院就诊，进行彻底的肛瘘切开，使新生肉芽组织，由内向外的生成，这样才能加快肛门脓肿和肛瘘的愈合。