股骨头骨骺骨软骨病病因尚未完全明确，目前认为其主要与儿童髋关节解剖及生理因素、内分泌异常、环境因素以及遗传因素有关，本病好发于髋关节反复受伤、磨损者、家族中有股骨头骨骺骨软骨病患者，以及患儿出生时父母年龄较大或家庭生活贫困者，创伤等因素可以诱发本病。
一、主要病因
1、儿童髋关节解剖及生理因素：儿童髋关节解剖及生理因素是股骨头骨骺骨软骨病最主要的病因，儿童髋臼小而浅，股骨头发育不完全，关节稳定性差，股骨头骨骺骨软骨病的发生可能与头臼之间的接触不当有关。儿童颈干角大，股骨头承受压力较成人大，也可能是股骨头骨骺骨软骨病的发病原因之一。儿童股骨头血供主要有股骨颈升动脉、圆韧带动脉和干骺端动脉、颈升动脉环绕股骨颈，4~8岁的男童颈升动脉在股骨颈前方的血管网稀少，圆韧带动脉闭锁，骺板阻挡干骺端血运，股骨头供血主要依赖于股骨颈升动脉，如果股骨颈前方血管网阻塞，可导致股骨头骨骺骨软骨病的发生。
2、骺外侧动脉起始部受阻：髋关节选择性血管造影证实，股骨头骨骺骨软骨病患儿的髋关节骺外侧动脉起始部有血流障碍，提示骺外侧动脉起始部受阻可能是引起股骨头骨骺骨软骨病的原因之一。股骨上端骨髓测压发现患侧骨髓高压，导致髋关节囊静脉淤血梗阻，股骨头毛细血管阻塞，也是股骨头骨骺骨软骨病产生的可能原因。胎儿及新生儿的股骨头颈均为软骨，骺内静脉回流靠股骨头韧带静脉、滑膜下静脉网、颈升静脉，若髋关节囊内压力增高，骨内静脉瘀血，从而继发动脉血供障碍，也可导致股骨头骨骺骨软骨病。
3、内分泌异常：股骨头骨骺骨软骨病患儿生长激素水平较同龄儿低，股骨头骨化延迟，软骨增厚，骨骺周围难以长入血管，诱发和/或加重缺血。另外，股骨头骨骺受累程度与血浆甲状腺素水平成正比，提示甲状腺素紊乱可能与此病也有关系。
4、环境因素：包括胎儿出生前后的各方面环境因素，如胎儿出生时父母年龄较大、生活贫困等因素，都可能与本病发生相关。
5、遗传因素：股骨头骨骺骨软骨病有一定的家族遗传倾向，患者的兄弟和第1级、第2级亲属中的发病机会增加，但有关研究尚未找到遗传学证据。
二、诱发因素
髋关节是一个活动量大的负重关节，反复轻微的损伤可能诱发股骨头骨骺骨软骨病的发生。