在临床患者出现痰黄绿色，一般是呼吸系统细菌感染性疾病所导致，可以用抗生素抗感染治疗，比如可以用青霉素类的阿莫西林、阿莫西林克拉维酸钾，还有头孢菌素类的头孢呋辛、头孢羟氨苄，或者大环内酯类的阿奇霉素。如果是大于18岁以上的成人，也可以用喹诺酮类的抗生素，比如莫西沙星，进行抗感染治疗。
患者咯黄绿色的痰主要见于铜绿假单胞菌感染，这个时候就要选用能够覆盖铜绿假单胞菌的抗生素，常用的有青霉素类的注射用哌拉西林钠他唑巴坦钠、注射用哌拉西林钠他唑巴坦钠，头孢菌素类的头孢他啶、注射用头孢哌酮钠舒巴坦钠，还有喹诺酮类的环丙沙星，或者氨基糖苷类的阿米卡星等，能够覆盖到铜绿假单胞菌的抗生素，进行抗感染治疗。