丙型肝炎的潜伏期跨度比较大，在2周到6个月左右。通常在感染后1-2周即可在感染者体内检测到丙肝病毒。
丙肝病毒感染人体后可以分为急性丙肝和慢性丙肝两种临床过程，其临床症状一般较轻，隐性感染及无症状慢性丙型肝炎多见。约有40%-75%的急性丙型肝炎患者无症状，慢性丙型肝炎临床表现视病情轻重而定，可以进展为肝硬化和肝癌。多数急性丙型肝炎患者无明显的症状，如有症状，以全身乏力为主要表现，还可出现食欲下降、恶心、腹胀、右季肋部疼痛。少数会伴有低热、轻度肝肿大，部分患者会出现脾肿大，少数患者会出现黄疸。
大多数慢性丙型肝炎患者无症状或有非特异性症状，如慢性疲劳和抑郁，其症状通常具有隐匿性，进展缓慢。一般在献血或体检时发现，确诊后应积极进行治疗。