CT在临床上应用的非常广泛，正常人偶尔做CT对于检查者的身体没有太大的影响，因为CT虽然使用的是X线有一定量的辐射，但是都在国家控制的安全范围之内。
不过如果有些患者把CT作为体检的一种方式，做全身或者多次频繁的扫描，对身体是有损伤的。因为受照射X线的剂量过多，会大量破坏人体的白细胞，导致免疫功能下降，或者出现一些其它的血液系统疾病。
如果甲状腺受照射的剂量过多，甲状腺病变的风险会增高，比如患者容易患有甲状腺癌等。如果性腺受照射的过多，容易导致不孕不育等并发症，其它的相应的部位比如眼部等受照射过多，也都会出现一系列的问题。