尖锐湿疣如果超过6个月没有复发，后期再复发的机会就不大了。尖锐湿疣治疗后非常容易复发，复发常见于治疗后的3-6个月内，复发之后用同样的治疗仍然会有效。大多数患者治疗后皮损可以改善或消退，治疗可能会减少人乳头瘤病毒感染，但不会根治感染。如果选择不治疗，尖锐湿疣也可以自行消退或者是保持不变，也可能是增多或增大。
尖锐湿疣治疗的目的是尽早清除肉眼可见的疣体，改善可能有的症状，减少复发，改善精神压力、美观。虽然治疗后尖锐湿疣复发几率比较高，但是大部分患者通过正确治疗最终可以达到和实现临床治愈。