卵巢囊肿比较小或者不影响内分泌是不会影响月经的，卵巢囊肿是卵巢上的细胞发育变异，基因突变导致的囊性肿物。卵巢囊肿分为生理性和病理性两种，生理性的卵巢囊肿在月经后会自行消退，不需要治疗，只要随诊观察就可以。病理性的卵巢囊肿分为几种，良性的囊肿<5cm，大部分不会影响内分泌功能，自然也不会影响月经。但是如果卵巢囊肿比较大或者性质有改变，从而影响了内分泌的功能，卵巢的功能受损就会影响月经。