小针刀治疗腰椎间盘突出的主要危害有以下几种：
第一、有可能导致局部肌肉的粘连；
第二、在小针刀治疗后，有可能会出现软组织感染。
因此，如果出现了腰椎间盘突出，首先要前往医院进行检查，明确严重程度以及相关症状。如果是单纯的肌肉痉挛、劳损引起，可以考虑适当进行小针刀治疗，但不要过多次进行小针刀手术。同时在小针刀治疗后要保持局部的干、洁，避免碰水，从而导致针眼处的感染，严重的可能会导致软组织感染，甚至可能会出现败血症的情况。因此，小针刀治疗腰椎间盘突出主要的危害是局部的肌肉粘连或软组织感染。