甲状腺炎的种类比较多，不同的类型治疗方法有比较大的差异，需要先检查甲功七项，甲状腺彩超和血常规明确原因。最常见的甲状腺炎为自身免疫性甲状腺炎，如果发现及时，可以用糖皮质激素控制症状。如果发现比较晚，形成了甲状腺的不可逆改变，则通常表现为甲减症状，甲状腺本身症状则比较轻微，可以用左甲状腺素等药物做替代治疗。
亚急性甲状腺容易有甲状腺的剧烈疼痛和肿大，容易早期发现，可以用阿司匹林、吲哚美辛等药物治疗，部分病人需要应用糖皮质激素。无痛性甲状腺炎则以对症治疗为主，心慌等症状可以用倍他乐克等药物治疗，合并甲减用甲状腺素等药物做替代治疗。颈部感染性疾病侵犯到甲状腺，可以针对病原体选择对应抗生素治疗。