影响结石形成的因素很多，年龄、性别、种族、遗传、环境因素、饮食习惯和职业对结石的形成影响很大，身体的代谢异常、尿路的梗阻、感染、异物和药物的使用也是结石形成的常见病因，重视这些问题能够减少结石的形成和复发，原因如下：
第一部分，代谢异常，常见的有尿液酸碱度异常，如高钙血症、高钙尿症、高草酸尿症、高尿酸尿症、胱氨酸尿症、低枸橼酸尿症、低镁尿症等等。
第二部分，局部病因，比如梗阻、感染、尿路中存在异物，这些是诱发结石形成的主要局部因素。
第三部分，药物相关因素，一类是尿液的浓度高，而溶解度比较低的药物，比如氨苯蝶啶，一些治疗HIV感染的药物，如硅酸镁、磺胺类药物等等，这些药物本身就是结石的成分。能够诱发结石形成的药物，包括乙酰唑胺、维生素D、维生素C、皮质激素等等，这些药物在代谢的过程中导致了其它成分结石的形成。