精索静脉曲张目前发生的病因是不清楚的，人们也提出了一些假说，考虑和一些解剖病理因素有关，包括人体平时是多直立体位，使精索静脉内的血液必须克服重力自下而上的回流，同时静脉壁及邻近的结缔组织薄弱或者提睾肌发育不全，消弱了周围组织对精索内静脉的挤压作用。而精索内静脉的瓣膜缺损或者关闭不全，同时左侧精索静脉是直角进入肾静脉，压力比较高，且位于乙状结肠后面，易受肠道压迫影响其通畅性。
目前现在有一些新的提法，认为可能与盆腔静脉性疾病相关，可能存在盆腔静脉的一致性的病理改变，比如精索静脉痔疮、前列腺静脉丛扩张，甚至阴茎海绵体静脉瘘，而且它们彼此之间还会有一定的影响，所以现在有人提用盆腔静脉性疾病一体化这个名词来概括这个新观点，所以目前精索静脉曲张的病因仍然是并不清楚的。