辅酶Q10主要可以用于一些疾病的辅助治疗，辅酶Q10具有促进氧化磷酸化反应和保护生物细胞膜完整性的功能。辅酶Q10是生物体内广泛存在的脂溶性醌类化合物，对于人体的呼吸反应、新陈代谢都有非常重要的作用，是细胞呼吸和细胞代谢的激活剂，也是非常重要的抗氧化剂和非特异性的免疫增强剂。
它对缺血性的心肌具有一定的保护作用，可以降低外周阻力，有利于心衰的治疗。除此之外，还具有抗心脏毒性以及保肝的作用。基于它的药理作用，主要是可以用于疾病辅助治疗，比如可以用于心血管疾病，包括病毒性心肌炎、慢性心功能不全，也可以用于肝炎，比如病毒性肝炎、亚急性肝坏死、慢性活动性肝炎的辅助治疗。同时还可以用于癌症的综合治疗，可以减轻放、化疗所引起的不良反应。