目前只有总体畸形率的百分比参考值，对于正常男性也有部分精子畸形，但是这种畸形率是小于30%的。如果各种畸形类型的畸形率超过了70%，则为畸形精子症。
畸形精子症中头部的畸形往往是与生育的异常有关系。除此之外，尾部异常等也可以引起不同程度的生育问题。对于精子的畸形分类很多，畸形精子包括头、体、尾的形态变异，头部畸形有巨大头、无定形、双头等。体部畸形有体部的粗大、折裂、不完整等，尾部畸形有卷尾、双尾、缺尾等。所以对于精子畸形率的评判，则要根据总体畸形率的异常，并没有专门针对头部缺陷的精子百分比进行探讨。