早上小便混浊最常见于泌尿系感染引起的膀胱炎，病人出现慢性膀胱炎时由于感染性炎性物质刺激膀胱颈部会出现颈部黏膜红肿、糜烂，出现排尿困难，出现大量残余尿。
残余尿在膀胱内引起膀胱表面黏膜脱落，出现小便混浊现象。病人出现早上小便混浊现象时，需及时到泌尿外科就医，通过尿常规检查可以发现尿中细菌数升高、尿中白细胞升高。
如尿中细菌数和白细胞正常时，常常会发现尿中晶体数升高，通过规范的对症治疗，多数病人早上小便浑浊症状会明显好转。