控制传染源和切断传播途径的主要区别：一个是从源头上切断传染病的传播；另一个是从路径上切断传染病的传播，根本的目的都是防止传染病继续传播下去。管理传染源、控制传染源，最根本的主要是对感染的个体进行早期的发现，对传染病的接触者也进行早期的检疫，密切观察，做好药物预防或疫苗接种，从源头上让疾病不能传播。
切断传播途径，如果发现了感染者，但是做好隔离和消毒的措施，明确地从路径上把传染病过程切断，也会防止疾病的继续进展发展导致疾病的流行，所以最根本目的都是防止传染病的传播和流行。