引起急性肾小球肾炎的病因不同及病理改变不同，治疗方案会有不同。
急性链球菌感染后肾炎，是一类最常见的典型的急性肾小球肾炎，以该病为例，其治疗基本上是对症治疗，主要为预防和治疗水钠潴留，控制血容量从而达到减轻症状，控制水肿和高血压、预防并发症，及防治肾脏损害加重。
一般治疗包括卧床休息、利尿消肿、控制血压、低盐饮食、低蛋白低钾饮食。利尿治疗，限制水钠摄入以后，如果仍然浮肿可以加用利尿剂。在利尿以后，血压也会得到改善，如果血压仍高，可以加用钙离子拮抗剂降血压治疗。
对于出现高血压脑病的需要给予吸氧、降颅压减轻脑水肿的治疗。在利尿、降压，及给予硝普钠等减轻心脏前负荷以后仍然不能控制心力衰竭的时候，可以采用血液透析脱水治疗。
对于合并由新月体形成引起的急性肾功能损伤的患者，需要给予糖皮质激素冲击治疗，联合细胞毒性药物或者血浆置换治疗。
对于有明确的感染因素或者细菌培养阳性的患者，需要积极的应用抗生素抗感染治疗。