16岁女孩2-3个月的月经没来，一般首先还是要检查血、尿HCG，除外妊娠可能，必要时要进一步除外宫外孕、胚胎停育等特殊情况。除外妊娠之后，一般这种情况与女孩卵巢功能不健全，或者没有排卵、周期性雌孕激素分泌相关。没有周期性雌孕激素分泌就不会有周期性月经来潮，就常常表现为月经紊乱。
如果2-3个月都没来月经，有时子宫内膜较厚，如果不给予处理，会造成阴道大出血。所以常常要做B超检查，测量子宫内膜厚度，如果子宫内膜厚度超过1cm，要给予孕激素类药物促月经来潮，以免月经来潮时有阴道大出血。