口腔刺痛可能是由于体内B族维生素、维生素C或者微量元素缺乏所引起，常见于挑食或者偏食的人群。
由于维生素和微量元素的缺乏，很容易使舌头黏膜或者口腔内黏膜出现慢性炎症，从而导致口腔内有刺痛的感觉。
口腔刺痛还有可能是口腔局部患有口腔溃疡，溃疡的发病原因多种多样，比如体内营养元素的缺乏、机体免疫功能紊乱、口内致病因子数量过多、口内卫生情况不良都会导致口腔溃疡的发生，溃疡面会引起糜烂和疼痛。
还有可能是患有其他的黏膜疾病，比如患有扁平苔癣，其由免疫功能紊乱所引起，会导致黏膜局部有粗糙、发涩的感觉，同时也会有刺痛的现象。